Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms