Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EP300Q09472 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EP300Q09472 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms