Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms