Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms