Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms