Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP46P62068 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP46P62068 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP46P62068 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP46P62068 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP46P62068 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP46P62068 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP46P62068 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP46P62068 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP46P62068 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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