Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms