Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms