Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NESP48681 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NESP48681 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NESP48681 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NESP48681 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NESP48681 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NESP48681 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NESP48681 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NESP48681 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NESP48681 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NESP48681 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NESP48681 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms