Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARCN1P48444 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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