Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms