Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR1BP42025 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms