Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms