Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGER1P34995 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGER1P34995 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTGER1P34995 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms