Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms