Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRMP28827 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms