Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms