Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms