Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms