Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRCP08575 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRCP08575 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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