Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPLNO95428 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms