Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DENRO43583 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DENRO43583 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DENRO43583 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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