Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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