Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCAO15360 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCAO15360 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms