Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCER2I3L3R5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms