Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms