Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC169A6NNP5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms