Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3CA6NKF2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3CA6NKF2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms