Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP3M1Q9Y2T2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP3M1Q9Y2T2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms