Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RCE1Q9Y256 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RCE1Q9Y256 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RCE1Q9Y256 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RCE1Q9Y256 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RCE1Q9Y256 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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