Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms