Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms