Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms