Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PARVAQ9NVD7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms