Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTNNBIP1Q9NSA3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms