Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDFQ9HBH1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms