Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms