Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms