Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms