Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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NIPSNAP1Q9BPW8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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NIPSNAP1Q9BPW8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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NIPSNAP1Q9BPW8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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