Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms