Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms