Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms