Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms