Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms