Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms