Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms