Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms