Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms