Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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